Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA2O43921 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA2O43921 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms