Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOPO43791 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPOPO43791 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOPO43791 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOPO43791 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOPO43791 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOPO43791 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOPO43791 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOPO43791 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOPO43791 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOPO43791 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOPO43791 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOPO43791 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOPO43791 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOPO43791 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOPO43791 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOPO43791 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOPO43791 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOPO43791 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOPO43791 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOPO43791 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOPO43791 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOPO43791 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOPO43791 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOPO43791 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOPO43791 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOPO43791 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOPO43791 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOPO43791 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOPO43791 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOPO43791 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOPO43791 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOPO43791 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOPO43791 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOPO43791 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOPO43791 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOPO43791 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOPO43791 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOPO43791 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOPO43791 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOPO43791 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOPO43791 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOPO43791 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOPO43791 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOPO43791 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOPO43791 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOPO43791 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOPO43791 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOPO43791 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOPO43791 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOPO43791 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOPO43791 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOPO43791 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOPO43791 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOPO43791 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPOPO43791 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPOPO43791 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SPOPO43791 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPOPO43791 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPOPO43791 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOPO43791 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOPO43791 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOPO43791 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOPO43791 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOPO43791 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOPO43791 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOPO43791 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOPO43791 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOPO43791 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOPO43791 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOPO43791 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOPO43791 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOPO43791 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOPO43791 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOPO43791 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOPO43791 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOPO43791 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOPO43791 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOPO43791 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOPO43791 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOPO43791 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOPO43791 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOPO43791 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOPO43791 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOPO43791 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOPO43791 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms