Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms