Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAPO00193 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAPO00193 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAPO00193 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAPO00193 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAPO00193 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAPO00193 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAPO00193 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAPO00193 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAPO00193 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAPO00193 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAPO00193 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAPO00193 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAPO00193 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAPO00193 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAPO00193 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAPO00193 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAPO00193 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAPO00193 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAPO00193 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAPO00193 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAPO00193 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAPO00193 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAPO00193 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAPO00193 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAPO00193 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAPO00193 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAPO00193 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAPO00193 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAPO00193 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAPO00193 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAPO00193 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAPO00193 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAPO00193 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAPO00193 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAPO00193 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAPO00193 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAPO00193 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAPO00193 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAPO00193 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAPO00193 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAPO00193 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAPO00193 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAPO00193 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAPO00193 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAPO00193 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAPO00193 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAPO00193 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAPO00193 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAPO00193 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAPO00193 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAPO00193 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAPO00193 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAPO00193 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAPO00193 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAPO00193 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAPO00193 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAPO00193 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAPO00193 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAPO00193 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAPO00193 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAPO00193 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAPO00193 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAPO00193 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAPO00193 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAPO00193 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAPO00193 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAPO00193 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAPO00193 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAPO00193 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAPO00193 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAPO00193 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAPO00193 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAPO00193 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAPO00193 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAPO00193 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAPO00193 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAPO00193 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAPO00193 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAPO00193 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms