Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DGG1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DGG1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DGG1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DGG1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DGG1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DGG1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DGG1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DGG1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DGG1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DGG1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DGG1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DGG1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DGG1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DGG1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DGG1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DGG1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DGG1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DGG1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DGG1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DGG1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DGG1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DGG1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DGG1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DGG1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DGG1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DGG1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DGG1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DGG1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DGG1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DGG1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DGG1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DGG1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DGG1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DGG1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DGG1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DGG1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DGG1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DGG1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DGG1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DGG1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B4DGG1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DGG1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DGG1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DGG1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DGG1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DGG1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DGG1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DGG1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DGG1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DGG1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DGG1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DGG1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DGG1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DGG1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DGG1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DGG1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DGG1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DGG1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DGG1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DGG1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DGG1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DGG1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DGG1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DGG1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DGG1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DGG1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DGG1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DGG1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DGG1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DGG1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DGG1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DGG1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DGG1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DGG1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DGG1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DGG1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DGG1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DGG1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DGG1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DGG1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DGG1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DGG1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DGG1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DGG1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DGG1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DGG1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DGG1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DGG1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DGG1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DGG1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DGG1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DGG1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DGG1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DGG1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B4DGG1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B4DGG1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B4DGG1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B4DGG1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B4DGG1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms