Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00587B1AMM8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms