Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO5BA8MYB1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5BA8MYB1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms