Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC69A6NI79 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms