Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPIPB15A6NHN6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms