Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP73A6NFT4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP73A6NFT4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms