Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRGMA1A4Y4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRGMA1A4Y4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms