Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms