Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PKD2L1Q9P0L9 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PKD2L1Q9P0L9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PKD2L1Q9P0L9 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PKD2L1Q9P0L9 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PKD2L1Q9P0L9 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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