Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM7Q9BQ49 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms