Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms