Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RHBDL3P58872 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms