Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CLDN9O95484 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLDN9O95484 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN9O95484 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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