Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHF8Q9UPP1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF8Q9UPP1 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF8Q9UPP1 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHF8Q9UPP1 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms