Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms