Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NBR1Q14596 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms