Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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SRSF5Q13243 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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SRSF5Q13243 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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SRSF5Q13243 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SRSF5Q13243 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SRSF5Q13243 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SRSF5Q13243 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SRSF5Q13243 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SRSF5Q13243 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRSF5Q13243 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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