Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms