Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.7 ms