Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 GRID1-201ENST00000327946 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP6C-202ENST00000415905 4172 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM5-202ENST00000537494 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NRP1-208ENST00000395995 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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