Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CCDC142Q17RM4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CCDC142Q17RM4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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