Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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NRF1Q16656 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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