Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SRSF2Q01130 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms