Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms