Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms