Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DENRO43583 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
DENRO43583 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
DENRO43583 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DENRO43583 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DENRO43583 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
DENRO43583 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DENRO43583 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DENRO43583 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DENRO43583 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DENRO43583 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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