Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms