Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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RNF148Q8N7C7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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RNF148Q8N7C7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF148Q8N7C7 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF148Q8N7C7 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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