Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms