Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
FHL3Q13643 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms