Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IFFO1Q0D2I5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms