Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms