Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP8P40818 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP8P40818 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP8P40818 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms