Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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