Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BBS2Q9BXC9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms