Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms