Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms