Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 457.5 ms