Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4L6Q3SYB3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms