Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms