Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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