Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms