Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP164Q9UPV0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP164Q9UPV0 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms