Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
USP34Q70CQ2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms