Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SDK2Q58EX2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SDK2Q58EX2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms