Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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